电影《谜之旅馆》的故事发生在一个偏僻的山区，一家名叫“黑暗酒店”的旅馆突然出现在小镇上。这家旅馆迎接着各式各样的客人，但每个客人都无一例外地在离开时神秘失踪了。主人公——一个年轻的作家，在听说这家旅馆被称为“死亡之地”后，踏上了解开背后谜团的旅程。他潜入旅馆，在那里发现了一间阴森的地下室，迷宫般的通道里摆满了一对对眼球。随着调查的进行，作家发现旅馆主人是一个生物学家，他的研究对象竟然是瞎眼生物。他发现这种瞎眼生物能通过吞噬其他生物的眼球来获取智慧和力量。这个生物学家利用这种生物制作了一种注射液，将其注射给了所有来旅馆的客人，将他们变成了追求眼球的疯狂怪物。作家最终发现，自己也是那名生物学家注射液的实验对象之一。而整个旅馆，其实是一个巨大的实验室，目的是为了研究这些瞎眼生物的秘密。作家为了逃离这个恐怖的实验室，决定与其他幸存者一起对抗这些怪物，将真相揭露出来，拯救自己和其他人的生命。